Captain Kirk en zijn dierbare bemanning zijn vertrokken voor een nieuwe ruimtemissie die meerdere jaren in beslag zal nemen. Maar niet alle buitenaardse levensvormen die het pad van de Enterprise kruisen, zijn even vredelievend. Na een aanval van de vijandige alien Krall moeten Kirk en de zijnen een noodlanding maken op een onbekende planeet. Ook daar loert het gevaar ...